Factors Affecting Splicing Strength of Yeast Genes
المؤلفون المشاركون
المصدر
Comparative and Functional Genomics
العدد
المجلد 2011، العدد 2011 (31 ديسمبر/كانون الأول 2011)، ص ص. 1-13، 13ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2011-11-20
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
13
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Accurate and efficient splicing is of crucial importance for highly-transcribed intron-containing genes (ICGs) in rapidly replicating unicellular eukaryotes such as the budding yeast Saccharomyces cerevisiae.
We characterize the 5′ and 3′ splice sites (ss) by position weight matrix scores (PWMSs), which is the highest for the consensus sequence and the lowest for splice sites differing most from the consensus sequence and used PWMS as a proxy for splicing strength.
HAC1, which is known to be spliced by a nonspliceosomal mechanism, has the most negative PWMS for both its 5′ ss and 3′ ss.
Several genes under strong splicing regulation and requiring additional splicing factors for their splicing also have small or negative PWMS values.
Splicing strength is higher for highly transcribed ICGs than for lowly transcribed ICGs and higher for transcripts that bind strongly to spliceosomes than those that bind weakly.
The 3′ splice site features a prominent poly-U tract before the 3′AG.
Our results suggest the potential of using PWMS as a screening tool for ICGs that are either spliced by a nonspliceosome mechanism or under strong splicing regulation in yeast and other fungal species.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Ma, Pinchao& Xia, Xuhua. 2011. Factors Affecting Splicing Strength of Yeast Genes. Comparative and Functional Genomics،Vol. 2011, no. 2011, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-454905
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Ma, Pinchao& Xia, Xuhua. Factors Affecting Splicing Strength of Yeast Genes. Comparative and Functional Genomics No. 2011 (2011), pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-454905
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Ma, Pinchao& Xia, Xuhua. Factors Affecting Splicing Strength of Yeast Genes. Comparative and Functional Genomics. 2011. Vol. 2011, no. 2011, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-454905
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-454905
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر