Power Analysis of C-TDT for Small Sample Size Genome-Wide Association Studies by the Joint Use of Case-Parent Trios and Pairs
المؤلفون المشاركون
Rajabli, Farid
Ilk, Ozlem
Inan, Gul
المصدر
Computational and Mathematical Methods in Medicine
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-05-02
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
In family-based genetic association studies, it is possible to encounter missing genotype information for one of the parents.
This leads to a study consisting of both case-parent trios and case-parent pairs.
One of the approaches to this problem is permutation-based combined transmission disequilibrium test statistic.
However, it is still unknown how powerful this test statistic is with small sample sizes.
In this paper, a simulation study is carried out to estimate the power and false positive rate of this test across different sample sizes for a family-based genome-wide association study.
It is observed that a statistical power of over 80% and a reasonable false positive rate estimate can be achieved even with a combination of 50 trios and 30 pairs when 2% of the SNPs are assumed to be associated.
Moreover, even smaller samples provide high power when smaller percentages of SNPs are associated with the disease.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Rajabli, Farid& Inan, Gul& Ilk, Ozlem. 2013. Power Analysis of C-TDT for Small Sample Size Genome-Wide Association Studies by the Joint Use of Case-Parent Trios and Pairs. Computational and Mathematical Methods in Medicine،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-456094
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Rajabli, Farid…[et al.]. Power Analysis of C-TDT for Small Sample Size Genome-Wide Association Studies by the Joint Use of Case-Parent Trios and Pairs. Computational and Mathematical Methods in Medicine No. 2013 (2013), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-456094
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Rajabli, Farid& Inan, Gul& Ilk, Ozlem. Power Analysis of C-TDT for Small Sample Size Genome-Wide Association Studies by the Joint Use of Case-Parent Trios and Pairs. Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-456094
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-456094
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر