An Integrative Approach to Infer Regulation Programs in a Transcription Regulatory Module Network
المؤلفون المشاركون
Qi, Jianlong
Michoel, Tom
Butler, Gregory
المصدر
Journal of Biomedicine and Biotechnology
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-04-11
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The module network method, a special type of Bayesian network algorithms, has been proposed to infer transcription regulatory networks from gene expression data.
In this method, a module represents a set of genes, which have similar expression profiles and are regulated by same transcription factors.
The process of learning module networks consists of two steps: first clustering genes into modules and then inferring the regulation program (transcription factors) of each module.
Many algorithms have been designed to infer the regulation program of a given gene module, and these algorithms show very different biases in detecting regulatory relationships.
In this work, we explore the possibility of integrating results from different algorithms.
The integration methods we select are union, intersection, and weighted rank aggregation.
Experiments in a yeast dataset show that the union and weighted rank aggregation methods produce more accurate predictions than those given by individual algorithms, whereas the intersection method does not yield any improvement in the accuracy of predictions.
In addition, somewhat surprisingly, the union method, which has a lower computational cost than rank aggregation, achieves comparable results as given by rank aggregation.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Qi, Jianlong& Michoel, Tom& Butler, Gregory. 2012. An Integrative Approach to Infer Regulation Programs in a Transcription Regulatory Module Network. Journal of Biomedicine and Biotechnology،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-456967
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Qi, Jianlong…[et al.]. An Integrative Approach to Infer Regulation Programs in a Transcription Regulatory Module Network. Journal of Biomedicine and Biotechnology No. 2012 (2012), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-456967
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Qi, Jianlong& Michoel, Tom& Butler, Gregory. An Integrative Approach to Infer Regulation Programs in a Transcription Regulatory Module Network. Journal of Biomedicine and Biotechnology. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-456967
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-456967
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر