Development and Evaluation of an Open-Source Software Package “CGITA” for Quantifying Tumor Heterogeneity with Molecular Images
المؤلفون المشاركون
Wang, Hung-Ming
Yen, Tzu-Chen
Lin, Chien-Yu
Fang, Yu-Hua Dean
Shih, Meng-Jung
Ho, Tsung-Ying
Liao, Chun-Ta
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-03-17
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Background.
The quantification of tumor heterogeneity with molecular images, by analyzing the local or global variation in the spatial arrangements of pixel intensity with texture analysis, possesses a great clinical potential for treatment planning and prognosis.
To address the lack of available software for computing the tumor heterogeneity on the public domain, we develop a software package, namely, Chang-Gung Image Texture Analysis (CGITA) toolbox, and provide it to the research community as a free, open-source project.
Methods.
With a user-friendly graphical interface, CGITA provides users with an easy way to compute more than seventy heterogeneity indices.
To test and demonstrate the usefulness of CGITA, we used a small cohort of eighteen locally advanced oral cavity (ORC) cancer patients treated with definitive radiotherapies.
Results.
In our case study of ORC data, we found that more than ten of the current implemented heterogeneity indices outperformed SUVmean for outcome prediction in the ROC analysis with a higher area under curve (AUC).
Heterogeneity indices provide a better area under the curve up to 0.9 than the SUVmean and TLG (0.6 and 0.52, resp.).
Conclusions.
CGITA is a free and open-source software package to quantify tumor heterogeneity from molecular images.
CGITA is available for free for academic use at http://code.google.com/p/cgita.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Fang, Yu-Hua Dean& Lin, Chien-Yu& Shih, Meng-Jung& Wang, Hung-Ming& Ho, Tsung-Ying& Liao, Chun-Ta…[et al.]. 2014. Development and Evaluation of an Open-Source Software Package “CGITA” for Quantifying Tumor Heterogeneity with Molecular Images. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-457205
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Fang, Yu-Hua Dean…[et al.]. Development and Evaluation of an Open-Source Software Package “CGITA” for Quantifying Tumor Heterogeneity with Molecular Images. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-457205
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Fang, Yu-Hua Dean& Lin, Chien-Yu& Shih, Meng-Jung& Wang, Hung-Ming& Ho, Tsung-Ying& Liao, Chun-Ta…[et al.]. Development and Evaluation of an Open-Source Software Package “CGITA” for Quantifying Tumor Heterogeneity with Molecular Images. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-457205
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-457205
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر