Multidimensional Scaling Applied to Histogram-Based DNA Analysis
المؤلفون المشاركون
Costa, António C.
Quelhas, Maria Dulce
Tenreiro Machado, José António
المصدر
Comparative and Functional Genomics
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-07-24
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
This paper aims to study the relationships between chromosomal DNA sequences of twenty species.
We propose a methodology combining DNA-based word frequency histograms, correlation methods, and an MDS technique to visualize structural information underlying chromosomes (CRs) and species.
Four statistical measures are tested (Minkowski, Cosine, Pearson product-moment, and Kendall τ rank correlations) to analyze the information content of 421 nuclear CRs from twenty species.
The proposed methodology is built on mathematical tools and allows the analysis and visualization of very large amounts of stream data, like DNA sequences, with almost no assumptions other than the predefined DNA “word length.” This methodology is able to produce comprehensible three-dimensional visualizations of CR clustering and related spatial and structural patterns.
The results of the four test correlation scenarios show that the high-level information clusterings produced by the MDS tool are qualitatively similar, with small variations due to each correlation method characteristics, and that the clusterings are a consequence of the input data and not method’s artifacts.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Costa, António C.& Tenreiro Machado, José António& Quelhas, Maria Dulce. 2012. Multidimensional Scaling Applied to Histogram-Based DNA Analysis. Comparative and Functional Genomics،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-460692
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Costa, António C.…[et al.]. Multidimensional Scaling Applied to Histogram-Based DNA Analysis. Comparative and Functional Genomics No. 2012 (2012), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-460692
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Costa, António C.& Tenreiro Machado, José António& Quelhas, Maria Dulce. Multidimensional Scaling Applied to Histogram-Based DNA Analysis. Comparative and Functional Genomics. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-460692
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-460692
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر