Metadynamics Simulation Study on the Conformational Transformation of HhaI Methyltransferase : An Induced-Fit Base-Flipping Hypothesis
المؤلفون المشاركون
Zhu, Kongkai
Ye, Fei
Zheng, Mingyue
Zhao, Dan
Jiang, Hualiang
Jiang, Ren-Wang
Luo, Cheng
Chen, Shijie
Jin, Lu
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-13، 13ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-06-19
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
13
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
DNA methyltransferases play crucial roles in establishing and maintenance of DNA methylation, which is an important epigenetic mark.
Flipping the target cytosine out of the DNA helical stack and into the active site of protein provides DNA methyltransferases with an opportunity to access and modify the genetic information hidden in DNA.
To investigate the conversion process of base flipping in the HhaI methyltransferase (M.HhaI), we performed different molecular simulation approaches on M.HhaI-DNA-S-adenosylhomocysteine ternary complex.
The results demonstrate that the nonspecific binding of DNA to M.HhaI is initially induced by electrostatic interactions.
Differences in chemical environment between the major and minor grooves determine the orientation of DNA.
Gln237 at the target recognition loop recognizes the GCGC base pair from the major groove side by hydrogen bonds.
In addition, catalytic loop motion is a key factor during this process.
Our study indicates that base flipping is likely to be an “induced-fit” process.
This study provides a solid foundation for future studies on the discovery and development of mechanism-based DNA methyltransferases regulators.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Jin, Lu& Ye, Fei& Zhao, Dan& Chen, Shijie& Zhu, Kongkai& Zheng, Mingyue…[et al.]. 2014. Metadynamics Simulation Study on the Conformational Transformation of HhaI Methyltransferase : An Induced-Fit Base-Flipping Hypothesis. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-461870
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Jin, Lu…[et al.]. Metadynamics Simulation Study on the Conformational Transformation of HhaI Methyltransferase : An Induced-Fit Base-Flipping Hypothesis. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-461870
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Jin, Lu& Ye, Fei& Zhao, Dan& Chen, Shijie& Zhu, Kongkai& Zheng, Mingyue…[et al.]. Metadynamics Simulation Study on the Conformational Transformation of HhaI Methyltransferase : An Induced-Fit Base-Flipping Hypothesis. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-461870
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-461870
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر