![](/images/graphics-bg.png)
Evaluation and Comparison of Multiple Aligners for Next-Generation Sequencing Data Analysis
المؤلفون المشاركون
Vongsangnak, Wanwipa
Zhu, Fei
Tang, Yi-fei
Shang, Jing
Shen, Bairong
Zhang, Wenyu
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-16، 16ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-03-23
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
16
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Next-generation sequencing (NGS) technology has rapidly advanced and generated the massive data volumes.
To align and map the NGS data, biologists often randomly select a number of aligners without concerning their suitable feature, high performance, and high accuracy as well as sequence variations and polymorphisms existing on reference genome.
This study aims to systematically evaluate and compare the capability of multiple aligners for NGS data analysis.
To explore this capability, we firstly performed alignment algorithms comparison and classification.
We further used long-read and short-read datasets from both real-life and in silico NGS data for comparative analysis and evaluation of these aligners focusing on three criteria, namely, application-specific alignment feature, computational performance, and alignment accuracy.
Our study demonstrated the overall evaluation and comparison of multiple aligners for NGS data analysis.
This serves as an important guiding resource for biologists to gain further insight into suitable selection of aligners for specific and broad applications.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Shang, Jing& Zhu, Fei& Vongsangnak, Wanwipa& Tang, Yi-fei& Zhang, Wenyu& Shen, Bairong. 2014. Evaluation and Comparison of Multiple Aligners for Next-Generation Sequencing Data Analysis. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-462398
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Shang, Jing…[et al.]. Evaluation and Comparison of Multiple Aligners for Next-Generation Sequencing Data Analysis. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-462398
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Shang, Jing& Zhu, Fei& Vongsangnak, Wanwipa& Tang, Yi-fei& Zhang, Wenyu& Shen, Bairong. Evaluation and Comparison of Multiple Aligners for Next-Generation Sequencing Data Analysis. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-462398
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-462398
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)