![](/images/graphics-bg.png)
Pathway Detection from Protein Interaction Networks and Gene Expression Data Using Color-Coding Methods and A* Search Algorithms
المؤلفون المشاركون
Yeh, Cheng-Yu
Arias, Carlos Roberto
Yeh, Hsiang-Yuan
Soo, Von-Wun
المصدر
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-14، 14ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-04-01
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
14
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
With the large availability of protein interaction networks and microarray data supported, to identify the linear paths that have biological significance in search of a potential pathway is a challenge issue.
We proposed a color-coding method based on the characteristics of biological network topology and applied heuristic search to speed up color-coding method.
In the experiments, we tested our methods by applying to two datasets: yeast and human prostate cancer networks and gene expression data set.
The comparisons of our method with other existing methods on known yeast MAPK pathways in terms of precision and recall show that we can find maximum number of the proteins and perform comparably well.
On the other hand, our method is more efficient than previous ones and detects the paths of length 10 within 40 seconds using CPU Intel 1.73GHz and 1GB main memory running under windows operating system.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Yeh, Cheng-Yu& Yeh, Hsiang-Yuan& Arias, Carlos Roberto& Soo, Von-Wun. 2012. Pathway Detection from Protein Interaction Networks and Gene Expression Data Using Color-Coding Methods and A* Search Algorithms. The Scientific World Journal،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-462838
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Yeh, Cheng-Yu…[et al.]. Pathway Detection from Protein Interaction Networks and Gene Expression Data Using Color-Coding Methods and A* Search Algorithms. The Scientific World Journal No. 2012 (2012), pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-462838
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Yeh, Cheng-Yu& Yeh, Hsiang-Yuan& Arias, Carlos Roberto& Soo, Von-Wun. Pathway Detection from Protein Interaction Networks and Gene Expression Data Using Color-Coding Methods and A* Search Algorithms. The Scientific World Journal. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-462838
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-462838
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)