![](/images/graphics-bg.png)
Finding Biomarker Signatures in Pooled Sample Designs : A Simulation Framework for Methodological Comparisons
المؤلفون المشاركون
Repsilber, Dirk
Telaar, Anna
Nürnberg, Gerd
المصدر
العدد
المجلد 2010، العدد 2010 (31 ديسمبر/كانون الأول 2010)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2010-07-04
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Detection of discriminating patterns in gene expression data can be accomplished by using various methods of statistical learning.
It has been proposed that sample pooling in this context would have negative effects; however, pooling cannot always be avoided.
We propose a simulation framework to explicitly investigate the parameters of patterns, experimental design, noise, and choice of method in order to find out which effects on classification performance are to be expected.
We use a two-group classification task and simulated gene expression data with independent differentially expressed genes as well as bivariate linear patterns and the combination of both.
Our results show a clear increase of prediction error with pool size.
For pooled training sets powered partial least squares discriminant analysis outperforms discriminance analysis, random forests, and support vector machines with linear or radial kernel for two of three simulated scenarios.
The proposed simulation approach can be implemented to systematically investigate a number of additional scenarios of practical interest.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Telaar, Anna& Nürnberg, Gerd& Repsilber, Dirk. 2010. Finding Biomarker Signatures in Pooled Sample Designs : A Simulation Framework for Methodological Comparisons. Advances in Bioinformatics،Vol. 2010, no. 2010, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-463112
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Telaar, Anna…[et al.]. Finding Biomarker Signatures in Pooled Sample Designs : A Simulation Framework for Methodological Comparisons. Advances in Bioinformatics No. 2010 (2010), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-463112
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Telaar, Anna& Nürnberg, Gerd& Repsilber, Dirk. Finding Biomarker Signatures in Pooled Sample Designs : A Simulation Framework for Methodological Comparisons. Advances in Bioinformatics. 2010. Vol. 2010, no. 2010, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-463112
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-463112
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)