Integrating Gene Expression and Protein Interaction Data for Signaling Pathway Prediction of Alzheimer’s Disease
المؤلفون المشاركون
Yang, Yang
Zhang, Jingmao
Kong, Wei
Mou, Xiaoyang
المصدر
Computational and Mathematical Methods in Medicine
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-04-09
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Discovering the signaling pathway and regulatory network would provide significant advance in genome-wide understanding of pathogenesis of human diseases.
Despite the rich transcriptome data, the limitation for microarray data is unable to detect changes beyond transcriptional level and insufficient in reconstructing pathways and regulatory networks.
In our study, protein-protein interaction (PPI) data is introduced to add molecular biological information for predicting signaling pathway of Alzheimer’s disease (AD).
Combining PPI with gene expression data, significant genes are selected by modified linear regression model firstly.
Then, according to the biological researches that inflammation reaction plays an important role in the generation and deterioration of AD, NF-κB (nuclear factor-kappa B), as a significant inflammatory factor, has been selected as the beginning gene of the predicting signaling pathway.
Based on that, integer linear programming (ILP) model is proposed to reconstruct the signaling pathway between NF-κB and AD virulence gene APP (amyloid precursor protein).
The results identify 6 AD virulence genes included in the predicted inflammatory signaling pathway, and a large amount of molecular biological analysis shows the great understanding of the underlying biological process of AD.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Kong, Wei& Zhang, Jingmao& Mou, Xiaoyang& Yang, Yang. 2014. Integrating Gene Expression and Protein Interaction Data for Signaling Pathway Prediction of Alzheimer’s Disease. Computational and Mathematical Methods in Medicine،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-464163
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Kong, Wei…[et al.]. Integrating Gene Expression and Protein Interaction Data for Signaling Pathway Prediction of Alzheimer’s Disease. Computational and Mathematical Methods in Medicine No. 2014 (2014), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-464163
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Kong, Wei& Zhang, Jingmao& Mou, Xiaoyang& Yang, Yang. Integrating Gene Expression and Protein Interaction Data for Signaling Pathway Prediction of Alzheimer’s Disease. Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-464163
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-464163
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر