![](/images/graphics-bg.png)
Compositional Constraint Is the Key Force in Shaping Codon Usage Bias in Hemagglutinin Gene in H1N1 Subtype of Influenza A Virus
المؤلفون المشاركون
Deka, Himangshu
Chakraborty, Supriyo
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-07-17
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
It is vital to unravel the codon usage bias in order to gain insights into the evolutionary forces dictating the viral evolution process.
Influenza A virus has attracted attention of many investigators over the years due to high mutation rate and being cross-specific shift operational in the viral genome.
Several authors have reported that the codon usage bias is low in influenza A viruses, citing mutational pressure as the decisive force shaping up the codon usage in these viruses.
In this study, complete coding sequences of hemagglutinin genes for H1N1 subtype of influenza A virus have been explored for the possible codon usage bias acting upon these genes.
The results indicate overall low bias with peaking ENC values.
The GC content is found to be substantially low as against AT content in the silent codon sites.
Significant correlations were observed in between the compositional parameters versus AT3, implying the possible role of the latter in shaping codon usage profile in the viral hemagglutinin.
The data showed conspicuously that the sequences were A redundant with most codons preferring nucleotide A over others in the third synonymous codon site.
The results indicated the pivotal role of compositional pressure affecting codon usage in this virus.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Deka, Himangshu& Chakraborty, Supriyo. 2014. Compositional Constraint Is the Key Force in Shaping Codon Usage Bias in Hemagglutinin Gene in H1N1 Subtype of Influenza A Virus. International Journal of Genomics،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-464797
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Deka, Himangshu& Chakraborty, Supriyo. Compositional Constraint Is the Key Force in Shaping Codon Usage Bias in Hemagglutinin Gene in H1N1 Subtype of Influenza A Virus. International Journal of Genomics No. 2014 (2014), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-464797
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Deka, Himangshu& Chakraborty, Supriyo. Compositional Constraint Is the Key Force in Shaping Codon Usage Bias in Hemagglutinin Gene in H1N1 Subtype of Influenza A Virus. International Journal of Genomics. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-464797
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-464797
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)