A Novel Algorithm for Detecting Protein Complexes with the Breadth First Search
المؤلفون المشاركون
He, Yiming
Tang, Xiwei
Wang, Jianxin
Pan, Yi
Li, Min
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-04-10
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Most biological processes are carried out by protein complexes.
A substantial number of false positives of the protein-protein interaction (PPI) data can compromise the utility of the datasets for complexes reconstruction.
In order to reduce the impact of such discrepancies, a number of data integration and affinity scoring schemes have been devised.
The methods encode the reliabilities (confidence) of physical interactions between pairs of proteins.
The challenge now is to identify novel and meaningful protein complexes from the weighted PPI network.
To address this problem, a novel protein complex mining algorithm ClusterBFS (Cluster with Breadth-First Search) is proposed.
Based on the weighted density, ClusterBFS detects protein complexes of the weighted network by the breadth first search algorithm, which originates from a given seed protein used as starting-point.
The experimental results show that ClusterBFS performs significantly better than the other computational approaches in terms of the identification of protein complexes.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Tang, Xiwei& Wang, Jianxin& Li, Min& He, Yiming& Pan, Yi. 2014. A Novel Algorithm for Detecting Protein Complexes with the Breadth First Search. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-465309
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Tang, Xiwei…[et al.]. A Novel Algorithm for Detecting Protein Complexes with the Breadth First Search. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-465309
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Tang, Xiwei& Wang, Jianxin& Li, Min& He, Yiming& Pan, Yi. A Novel Algorithm for Detecting Protein Complexes with the Breadth First Search. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-465309
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-465309
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر