Simulated Annealing Based Algorithm for Identifying Mutated Driver Pathways in Cancer
المؤلفون المشاركون
Zheng, Chun-Hou
Li, Hai-Tao
Zhang, Yu-Lang
Wang, Hong-Qiang
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-05-26
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
With the development of next-generation DNA sequencing technologies, large-scale cancer genomics projects can be implemented to help researchers to identify driver genes, driver mutations, and driver pathways, which promote cancer proliferation in large numbers of cancer patients.
Hence, one of the remaining challenges is to distinguish functional mutations vital for cancer development, and filter out the unfunctional and random “passenger mutations.” In this study, we introduce a modified method to solve the so-called maximum weight submatrix problem which is used to identify mutated driver pathways in cancer.
The problem is based on two combinatorial properties, that is, coverage and exclusivity.
Particularly, we enhance an integrative model which combines gene mutation and expression data.
The experimental results on simulated data show that, compared with the other methods, our method is more efficient.
Finally, we apply the proposed method on two real biological datasets.
The results show that our proposed method is also applicable in real practice.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Li, Hai-Tao& Zhang, Yu-Lang& Zheng, Chun-Hou& Wang, Hong-Qiang. 2014. Simulated Annealing Based Algorithm for Identifying Mutated Driver Pathways in Cancer. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-467188
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Li, Hai-Tao…[et al.]. Simulated Annealing Based Algorithm for Identifying Mutated Driver Pathways in Cancer. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-467188
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Li, Hai-Tao& Zhang, Yu-Lang& Zheng, Chun-Hou& Wang, Hong-Qiang. Simulated Annealing Based Algorithm for Identifying Mutated Driver Pathways in Cancer. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-467188
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-467188
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر