Automation of cDNA Synthesis and Labelling Improves Reproducibility
المؤلفون المشاركون
Klevebring, Daniel
Lundeberg, Joakim
Eidefors, Anna
Gry, Marcus
Lindberg, Johan
المصدر
Journal of Biomedicine and Biotechnology
العدد
المجلد 2009، العدد 2009 (31 ديسمبر/كانون الأول 2009)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2009-10-15
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Background.
Several technologies, such as in-depth sequencing and microarrays, enable large-scale interrogation of genomes and transcriptomes.
In this study, we asses reproducibility and throughput by moving all laboratory procedures to a robotic workstation, capable of handling superparamagnetic beads.
Here, we describe a fully automated procedure for cDNA synthesis and labelling for microarrays, where the purification steps prior to and after labelling are based on precipitation of DNA on carboxylic acid-coated paramagnetic beads.
Results.
The fully automated procedure allows for samples arrayed on a microtiter plate to be processed in parallel without manual intervention and ensuring high reproducibility.
We compare our results to a manual sample preparation procedure and, in addition, use a comprehensive reference dataset to show that the protocol described performs better than similar manual procedures.
Conclusions.
We demonstrate, in an automated gene expression microarray experiment, a reduced variance between replicates, resulting in an increase in the statistical power to detect differentially expressed genes, thus allowing smaller differences between samples to be identified.
This protocol can with minor modifications be used to create cDNA libraries for other applications such as in-depth analysis using next-generation sequencing technologies.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Klevebring, Daniel& Gry, Marcus& Lindberg, Johan& Eidefors, Anna& Lundeberg, Joakim. 2009. Automation of cDNA Synthesis and Labelling Improves Reproducibility. Journal of Biomedicine and Biotechnology،Vol. 2009, no. 2009, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-468875
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Klevebring, Daniel…[et al.]. Automation of cDNA Synthesis and Labelling Improves Reproducibility. Journal of Biomedicine and Biotechnology No. 2009 (2009), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-468875
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Klevebring, Daniel& Gry, Marcus& Lindberg, Johan& Eidefors, Anna& Lundeberg, Joakim. Automation of cDNA Synthesis and Labelling Improves Reproducibility. Journal of Biomedicine and Biotechnology. 2009. Vol. 2009, no. 2009, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-468875
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-468875
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر