Application of an Integrative Computational Framework in Trancriptomic Data of Atherosclerotic Mice Suggests Numerous Molecular Players
المؤلفون المشاركون
Chatziioannou, Aristotelis
Kolisis, Fragiskos N.
Sirsjö, Allan
Papadodima, Olga
المصدر
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-11-06
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Atherosclerosis is a multifactorial disease involving a lot of genes and proteins recruited throughout its manifestation.
The present study aims to exploit bioinformatic tools in order to analyze microarray data of atherosclerotic aortic lesions of ApoE knockout mice, a model widely used in atherosclerosis research.
In particular, a dynamic analysis was performed among young and aged animals, resulting in a list of 852 significantly altered genes.
Pathway analysis indicated alterations in critical cellular processes related to cell communication and signal transduction, immune response, lipid transport, and metabolism.
Cluster analysis partitioned the significantly differentiated genes in three major clusters of similar expression profile.
Promoter analysis applied to functional related groups of the same cluster revealed shared putative cis-elements potentially contributing to a common regulatory mechanism.
Finally, by reverse engineering the functional relevance of differentially expressed genes with specific cellular pathways, putative genes acting as hubs, were identified, linking functionally disparate cellular processes in the context of traditional molecular description.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Papadodima, Olga& Sirsjö, Allan& Kolisis, Fragiskos N.& Chatziioannou, Aristotelis. 2012. Application of an Integrative Computational Framework in Trancriptomic Data of Atherosclerotic Mice Suggests Numerous Molecular Players. Advances in Bioinformatics،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-472799
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Papadodima, Olga…[et al.]. Application of an Integrative Computational Framework in Trancriptomic Data of Atherosclerotic Mice Suggests Numerous Molecular Players. Advances in Bioinformatics No. 2012 (2012), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-472799
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Papadodima, Olga& Sirsjö, Allan& Kolisis, Fragiskos N.& Chatziioannou, Aristotelis. Application of an Integrative Computational Framework in Trancriptomic Data of Atherosclerotic Mice Suggests Numerous Molecular Players. Advances in Bioinformatics. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-472799
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-472799
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر