![](/images/graphics-bg.png)
miRSeq : A User-Friendly Standalone Toolkit for Sequencing Quality Evaluation and miRNA Profiling
المؤلفون المشاركون
Pan, Cheng-Tsung
Lin, Wei-Chen
Tsai, Kuo-Wang
Li, Sung-Chou
Hung, Tzu-Min
Pan, Chao-Yu
Yu, Hong-Ren
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-07-01
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
MicroRNAs (miRNAs) present diverse regulatory functions in a wide range of biological activities.
Studies on miRNA functions generally depend on determining miRNA expression profiles between libraries by using a next-generation sequencing (NGS) platform.
Currently, several online web services are developed to provide small RNA NGS data analysis.
However, the submission of large amounts of NGS data, conversion of data format, and limited availability of species bring problems.
In this study, we developed miRSeq to provide alternatives.
To test the performance, we had small RNA NGS data from four species, including human, rat, fly, and nematode, analyzed with miRSeq.
The alignments results indicate that miRSeq can precisely evaluate the sequencing quality of samples regarding percentage of self-ligation read, read length distribution, and read category.
miRSeq is a user-friendly standalone toolkit featuring a graphical user interface (GUI).
After a simple installation, users can easily operate miRSeq on a PC or laptop by using a mouse.
Within minutes, miRSeq yields useful miRNA data, including miRNA expression profiles, 3′ end modification patterns, and isomiR forms.
Moreover, miRSeq supports the analysis of up to 105 animal species, providing higher flexibility.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Pan, Cheng-Tsung& Tsai, Kuo-Wang& Hung, Tzu-Min& Lin, Wei-Chen& Pan, Chao-Yu& Yu, Hong-Ren…[et al.]. 2014. miRSeq : A User-Friendly Standalone Toolkit for Sequencing Quality Evaluation and miRNA Profiling. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-473460
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Pan, Cheng-Tsung…[et al.]. miRSeq : A User-Friendly Standalone Toolkit for Sequencing Quality Evaluation and miRNA Profiling. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-473460
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Pan, Cheng-Tsung& Tsai, Kuo-Wang& Hung, Tzu-Min& Lin, Wei-Chen& Pan, Chao-Yu& Yu, Hong-Ren…[et al.]. miRSeq : A User-Friendly Standalone Toolkit for Sequencing Quality Evaluation and miRNA Profiling. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-473460
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-473460
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)