HKC : An Algorithm to Predict Protein Complexes in Protein-Protein Interaction Networks
المؤلفون المشاركون
Ye, Jun
Wang, Xiaomin
Wang, Zhengzhi
المصدر
Journal of Biomedicine and Biotechnology
العدد
المجلد 2011، العدد 2011 (31 ديسمبر/كانون الأول 2011)، ص ص. 1-14، 14ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2011-11-26
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
14
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
With the availability of more and more genome-scale protein-protein interaction (PPI) networks, research interests gradually shift to Systematic Analysis on these large data sets.
A key topic is to predict protein complexes in PPI networks by identifying clusters that are densely connected within themselves but sparsely connected with the rest of the network.
In this paper, we present a new topology-based algorithm, HKC, to detect protein complexes in genome-scale PPI networks.
HKC mainly uses the concepts of highest k-core and cohesion to predict protein complexes by identifying overlapping clusters.
The experiments on two data sets and two benchmarks show that our algorithm has relatively high F-measure and exhibits better performance compared with some other methods.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Xiaomin& Wang, Zhengzhi& Ye, Jun. 2011. HKC : An Algorithm to Predict Protein Complexes in Protein-Protein Interaction Networks. Journal of Biomedicine and Biotechnology،Vol. 2011, no. 2011, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-474875
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Xiaomin…[et al.]. HKC : An Algorithm to Predict Protein Complexes in Protein-Protein Interaction Networks. Journal of Biomedicine and Biotechnology No. 2011 (2011), pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-474875
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Xiaomin& Wang, Zhengzhi& Ye, Jun. HKC : An Algorithm to Predict Protein Complexes in Protein-Protein Interaction Networks. Journal of Biomedicine and Biotechnology. 2011. Vol. 2011, no. 2011, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-474875
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-474875
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر