Structural Modeling and Analysis of Pregnancy-Associated Glycoprotein-1 of Buffalo (Bubalus bubalis)
المؤلفون المشاركون
Andonissamy, Jerome
Agarwal, S. K.
Singh, S. K.
المصدر
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-03-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الملخص EN
The present study was conducted to design and analyze the structural model of buffalo pregnancy-associated glycoprotein-1 (PAG-1) using bioinformatics.
Structural modeling of the deduced buffalo PAG-1 protein was done using PHYRE, CONSURF servers and its structure was subsequently constructed using MODELLER 9.9 and PyMOL softwares Buffalo PAG-1 structural conformity was analyzed using PROSA, WHATIF, and 3D-PSSM servers.
Designed buffalo PAG-1 protein structure on BLAST analysis retrieved protein structures belonging to aspartic proteinase family.
Moreover in silico analysis revealed buffalo PAG-1 protein retained bilobed structure with pepstatin-binding clefts near the active sites by docking studies with pepstatin A using PatchDock server.
Structural studies revealed that the amino and carboxy terminal containing aspartic residues are highly conserved and buried within the protein structure.
Structural conformity studies showed that more than 90% of the residues lie inside favored and allowed regions.
It was also deduced that buffalo PAG-1 possesses low and high energy zones with a very low threshold for proteolysis ascertaining the stableness of the buffalo PAG-1 protein structure.
This study depicts the structural conformity and stability of buffalo PAG-1 protein.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Andonissamy, Jerome& Singh, S. K.& Agarwal, S. K.. 2012. Structural Modeling and Analysis of Pregnancy-Associated Glycoprotein-1 of Buffalo (Bubalus bubalis). ISRN Molecular Biology،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-475012
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Andonissamy, Jerome…[et al.]. Structural Modeling and Analysis of Pregnancy-Associated Glycoprotein-1 of Buffalo (Bubalus bubalis). ISRN Molecular Biology No. 2012 (2012), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-475012
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Andonissamy, Jerome& Singh, S. K.& Agarwal, S. K.. Structural Modeling and Analysis of Pregnancy-Associated Glycoprotein-1 of Buffalo (Bubalus bubalis). ISRN Molecular Biology. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-475012
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-475012
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر