Comparative Analysis of Mass Spectral Similarity Measures on Peak Alignment for Comprehensive Two-Dimensional Gas Chromatography Mass Spectrometry
المؤلفون المشاركون
المصدر
Computational and Mathematical Methods in Medicine
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-09-16
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Peak alignment is a critical procedure in mass spectrometry-based biomarker discovery in metabolomics.
One of peak alignment approaches to comprehensive two-dimensional gas chromatography mass spectrometry (GC×GC-MS) data is peak matching-based alignment.
A key to the peak matching-based alignment is the calculation of mass spectral similarity scores.
Various mass spectral similarity measures have been developed mainly for compound identification, but the effect of these spectral similarity measures on the performance of peak matching-based alignment still remains unknown.
Therefore, we selected five mass spectral similarity measures, cosine correlation, Pearson’s correlation, Spearman’s correlation, partial correlation, and part correlation, and examined their effects on peak alignment using two sets of experimental GC×GC-MS data.
The results show that the spectral similarity measure does not affect the alignment accuracy significantly in analysis of data from less complex samples, while the partial correlation performs much better than other spectral similarity measures when analyzing experimental data acquired from complex biological samples.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Kim, Seongho& Zhang, Xiang. 2013. Comparative Analysis of Mass Spectral Similarity Measures on Peak Alignment for Comprehensive Two-Dimensional Gas Chromatography Mass Spectrometry. Computational and Mathematical Methods in Medicine،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-477351
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Kim, Seongho& Zhang, Xiang. Comparative Analysis of Mass Spectral Similarity Measures on Peak Alignment for Comprehensive Two-Dimensional Gas Chromatography Mass Spectrometry. Computational and Mathematical Methods in Medicine No. 2013 (2013), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-477351
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Kim, Seongho& Zhang, Xiang. Comparative Analysis of Mass Spectral Similarity Measures on Peak Alignment for Comprehensive Two-Dimensional Gas Chromatography Mass Spectrometry. Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-477351
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-477351
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر