Three-Dimensional Molecular Modeling of a Diverse Range of SC Clan Serine Proteases
المؤلفون المشاركون
Rodger, Euan J.
Chatterjee, Somnath
Laskar, Aparna
Chatterjee, Aniruddha
المصدر
Molecular Biology International
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-11-19
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Serine proteases are involved in a variety of biological processes and are classified into clans sharing structural homology.
Although various three-dimensional structures of SC clan proteases have been experimentally determined, they are mostly bacterial and animal proteases, with some from archaea, plants, and fungi, and as yet no structures have been determined for protozoa.
To bridge this gap, we have used molecular modeling techniques to investigate the structural properties of different SC clan serine proteases from a diverse range of taxa.
Either SWISS-MODEL was used for homology-based structure prediction or the LOOPP server was used for threading-based structure prediction.
The predicted models were refined using Insight II and SCRWL and validated against experimental structures.
Investigation of secondary structures and electrostatic surface potential was performed using MOLMOL.
The structural geometry of the catalytic core shows clear deviations between taxa, but the relative positions of the catalytic triad residues were conserved.
Evolutionary divergence was also exhibited by large variation in secondary structure features outside the core, differences in overall amino acid distribution, and unique surface electrostatic potential patterns between species.
Encompassing a wide range of taxa, our structural analysis provides an evolutionary perspective on SC clan serine proteases.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Laskar, Aparna& Chatterjee, Aniruddha& Chatterjee, Somnath& Rodger, Euan J.. 2012. Three-Dimensional Molecular Modeling of a Diverse Range of SC Clan Serine Proteases. Molecular Biology International،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-482461
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Laskar, Aparna…[et al.]. Three-Dimensional Molecular Modeling of a Diverse Range of SC Clan Serine Proteases. Molecular Biology International No. 2012 (2012), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-482461
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Laskar, Aparna& Chatterjee, Aniruddha& Chatterjee, Somnath& Rodger, Euan J.. Three-Dimensional Molecular Modeling of a Diverse Range of SC Clan Serine Proteases. Molecular Biology International. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-482461
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-482461
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر