Inference of SNP-Gene Regulatory Networks by Integrating Gene Expressions and Genetic Perturbations
المؤلفون المشاركون
Gao, Jean X.
Liu, Chunyu
Kim, Dong-Chul
Wang, Jiao
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-06-09
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
In order to elucidate the overall relationships between gene expressions and genetic perturbations, we propose a network inference method to infer gene regulatory network where single nucleotide polymorphism (SNP) is involved as a regulator of genes.
In the most of the network inferences named as SNP-gene regulatory network (SGRN) inference, pairs of SNP-gene are given by separately performing expression quantitative trait loci (eQTL) mappings.
In this paper, we propose a SGRN inference method without predefined eQTL information assuming a gene is regulated by a single SNP at most.
To evaluate the performance, the proposed method was applied to random data generated from synthetic networks and parameters.
There are three main contributions.
First, the proposed method provides both the gene regulatory inference and the eQTL identification.
Second, the experimental results demonstrated that integration of multiple methods can produce competitive performances.
Lastly, the proposed method was also applied to psychiatric disorder data in order to explore how the method works with real data.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Kim, Dong-Chul& Wang, Jiao& Liu, Chunyu& Gao, Jean X.. 2014. Inference of SNP-Gene Regulatory Networks by Integrating Gene Expressions and Genetic Perturbations. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-486511
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Kim, Dong-Chul…[et al.]. Inference of SNP-Gene Regulatory Networks by Integrating Gene Expressions and Genetic Perturbations. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-486511
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Kim, Dong-Chul& Wang, Jiao& Liu, Chunyu& Gao, Jean X.. Inference of SNP-Gene Regulatory Networks by Integrating Gene Expressions and Genetic Perturbations. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-486511
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-486511
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر