Phylogenetic and Guanine-Cytosine Content Analysis of Symbiobacterium thermophilum Genes
المؤلفون المشاركون
Yun, Choong-Soo
Nishida, Hiromi
المصدر
International Journal of Evolutionary Biology
العدد
المجلد 2011، العدد 2011 (31 ديسمبر/كانون الأول 2011)، ص ص. 1-5، 5ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2010-12-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
5
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Although the bacterium Symbiobacterium thermophilum has a genome with a high guanine-cytosine (GC) content (69%), it belongs to a low GC content bacterial group.
We detected only 18 low GC content regions with 5 or more consecutive genes whose GC contents were below 65% in the genome of this organism.
S.
thermophilum has 66 transposase genes, which are markers of transposable genetic elements, and 38 (58%) of them were located in the low GC content regions, suggesting that Symbiobacterium has a similar gene silencing system as Salmonella.
The top hit (best match) analyses for each Symbiobacterium protein showed that putative horizontally transferred genes and vertically inherited genes are scattered across the genome.
Approximately 25% of the 3338 Symbiobacterium proteins have the highest similarity with the protein of a phylogenetically distant organism.
The putative horizontally transferred genes also have a high GC content, suggesting that Symbiobacterium has gained many DNA fragments from phylogenetically distant organisms during the early stage of Firmicutes evolution.
After acquiring genes, Symbiobacterium increased the GC content of the horizontally transferred genes and thereby maintained a genome with a high GC content.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Nishida, Hiromi& Yun, Choong-Soo. 2010. Phylogenetic and Guanine-Cytosine Content Analysis of Symbiobacterium thermophilum Genes. International Journal of Evolutionary Biology،Vol. 2011, no. 2011, pp.1-5.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-486858
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Nishida, Hiromi& Yun, Choong-Soo. Phylogenetic and Guanine-Cytosine Content Analysis of Symbiobacterium thermophilum Genes. International Journal of Evolutionary Biology No. 2011 (2011), pp.1-5.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-486858
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Nishida, Hiromi& Yun, Choong-Soo. Phylogenetic and Guanine-Cytosine Content Analysis of Symbiobacterium thermophilum Genes. International Journal of Evolutionary Biology. 2010. Vol. 2011, no. 2011, pp.1-5.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-486858
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-486858
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر