Additions to the Human Plasma Proteome via a Tandem MARS Depletion iTRAQ-Based Workflow
المؤلفون المشاركون
Cao, Zhiyun
Yende, Sachin
Robinson, Renã A. S.
Kellum, John A.
المصدر
International Journal of Proteomics
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-02-19
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Robust platforms for determining differentially expressed proteins in biomarker and discovery studies using human plasma are of great interest.
While increased depth in proteome coverage is desirable, it is associated with costs of experimental time due to necessary sample fractionation.
We evaluated a robust quantitative proteomics workflow for its ability (1) to provide increased depth in plasma proteome coverage and (2) to give statistical insight useful for establishing differentially expressed plasma proteins.
The workflow involves dual-stage immunodepletion on a multiple affinity removal system (MARS) column, iTRAQ tagging, offline strong-cation exchange chromatography, and liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC-MS/MS).
Independent workflow experiments were performed in triplicate on four plasma samples tagged with iTRAQ 4-plex reagents.
After stringent criteria were applied to database searched results, 689 proteins with at least two spectral counts (SC) were identified.
Depth in proteome coverage was assessed by comparison to the 2010 Human Plasma Proteome Reference Database in which our studies reveal 399 additional proteins which have not been previously reported.
Additionally, we report on the technical variation of this quantitative workflow which ranges from ±11 to 30%.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Cao, Zhiyun& Yende, Sachin& Kellum, John A.& Robinson, Renã A. S.. 2013. Additions to the Human Plasma Proteome via a Tandem MARS Depletion iTRAQ-Based Workflow. International Journal of Proteomics،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-488624
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Cao, Zhiyun…[et al.]. Additions to the Human Plasma Proteome via a Tandem MARS Depletion iTRAQ-Based Workflow. International Journal of Proteomics No. 2013 (2013), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-488624
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Cao, Zhiyun& Yende, Sachin& Kellum, John A.& Robinson, Renã A. S.. Additions to the Human Plasma Proteome via a Tandem MARS Depletion iTRAQ-Based Workflow. International Journal of Proteomics. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-488624
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-488624
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر