Effects of Taxon Sampling in Reconstructions of Intron Evolution
المؤلفون المشاركون
Nikitin, Mikhail A.
Aleoshin, Vladimir V.
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-03-03
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Introns comprise a considerable portion of eukaryotic genomes; however, their evolution is understudied.
Numerous works of the last years largely disagree on many aspects of intron evolution.
Interpretation of these differences is hindered because different algorithms and taxon sampling strategies were used.
Here, we present the first attempt of a systematic evaluation of the effects of taxon sampling on popular intron evolution estimation algorithms.
Using the “taxon jackknife” method, we compared the effect of taxon sampling on the behavior of intron evolution inferring algorithms.
We show that taxon sampling can dramatically affect the inferences and identify conditions where algorithms are prone to systematic errors.
Presence or absence of some key species is often more important than the taxon sampling size alone.
Criteria of representativeness of the taxonomic sampling for reliable reconstructions are outlined.
Presence of the deep-branching species with relatively high intron density is more important than sheer number of species.
According to these criteria, currently available genomic databases are representative enough to provide reliable inferences of the intron evolution in animals, land plants, and fungi, but they underrepresent many groups of unicellular eukaryotes, including the well-studied Alveolata.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Nikitin, Mikhail A.& Aleoshin, Vladimir V.. 2013. Effects of Taxon Sampling in Reconstructions of Intron Evolution. International Journal of Genomics،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-489187
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Nikitin, Mikhail A.& Aleoshin, Vladimir V.. Effects of Taxon Sampling in Reconstructions of Intron Evolution. International Journal of Genomics No. 2013 (2013), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-489187
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Nikitin, Mikhail A.& Aleoshin, Vladimir V.. Effects of Taxon Sampling in Reconstructions of Intron Evolution. International Journal of Genomics. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-489187
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-489187
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر