![](/images/graphics-bg.png)
Basin Hopping as a General and Versatile Optimization Framework for the Characterization of Biological Macromolecules
المؤلفون المشاركون
Molloy, Kevin
Hashmi, Irina
Olson, Brian
Shehu, Amarda
المصدر
Advances in Artificial Intelligence
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-19، 19ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-12-04
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
19
التخصصات الرئيسية
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
علوم
الملخص EN
Since its introduction, the basin hopping (BH) framework has proven useful for hard nonlinear optimization problems with multiple variables and modalities.
Applications span a wide range, from packing problems in geometry to characterization of molecular states in statistical physics.
BH is seeing a reemergence in computational structural biology due to its ability to obtain a coarse-grained representation of the protein energy surface in terms of local minima.
In this paper, we show that the BH framework is general and versatile, allowing to address problems related to the characterization of protein structure, assembly, and motion due to its fundamental ability to sample minima in a high-dimensional variable space.
We show how specific implementations of the main components in BH yield algorithmic realizations that attain state-of-the-art results in the context of ab initio protein structure prediction and rigid protein-protein docking.
We also show that BH can map intermediate minima related with motions connecting diverse stable functionally relevant states in a protein molecule, thus serving as a first step towards the characterization of transition trajectories connecting these states.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Olson, Brian& Hashmi, Irina& Molloy, Kevin& Shehu, Amarda. 2012. Basin Hopping as a General and Versatile Optimization Framework for the Characterization of Biological Macromolecules. Advances in Artificial Intelligence،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-19.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-489535
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Olson, Brian…[et al.]. Basin Hopping as a General and Versatile Optimization Framework for the Characterization of Biological Macromolecules. Advances in Artificial Intelligence No. 2012 (2012), pp.1-19.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-489535
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Olson, Brian& Hashmi, Irina& Molloy, Kevin& Shehu, Amarda. Basin Hopping as a General and Versatile Optimization Framework for the Characterization of Biological Macromolecules. Advances in Artificial Intelligence. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-19.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-489535
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-489535
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)