![](/images/graphics-bg.png)
Comparative (Computational) Analysis of the DNA Methylation Status of Trinucleotide Repeat Expansion Diseases
المؤلفون المشاركون
Taylor, Simon J. E.
Payne, Annette
Pook, Mark A.
Ghorbani, Mohammadmersad
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-12-23
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Previous studies have examined DNA methylation in different trinucleotide repeat diseases.
We have combined this data and used a pattern searching algorithm to identify motifs in the DNA surrounding aberrantly methylated CpGs found in the DNA of patients with one of the three trinucleotide repeat (TNR) expansion diseases: fragile X syndrome (FRAXA), myotonic dystrophy type I (DM1), or Friedreich’s ataxia (FRDA).
We examined sequences surrounding both the variably methylated (VM) CpGs, which are hypermethylated in patients compared with unaffected controls, and the nonvariably methylated CpGs which remain either always methylated (AM) or never methylated (NM) in both patients and controls.
Using the J48 algorithm of WEKA analysis, we identified that two patterns are all that is necessary to classify our three regions CCGG* which is found in VM and not in AM regions and AATT* which distinguished between NM and VM + AM using proportional frequency.
Furthermore, comparing our software with MEME software, we have demonstrated that our software identifies more patterns than MEME in these short DNA sequences.
Thus, we present evidence that the DNA sequence surrounding CpG can influence its susceptibility to be de novo methylated in a disease state associated with a trinucleotide repeat.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Ghorbani, Mohammadmersad& Taylor, Simon J. E.& Pook, Mark A.& Payne, Annette. 2013. Comparative (Computational) Analysis of the DNA Methylation Status of Trinucleotide Repeat Expansion Diseases. Journal of Nucleic Acids،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-490761
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Ghorbani, Mohammadmersad…[et al.]. Comparative (Computational) Analysis of the DNA Methylation Status of Trinucleotide Repeat Expansion Diseases. Journal of Nucleic Acids No. 2013 (2013), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-490761
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Ghorbani, Mohammadmersad& Taylor, Simon J. E.& Pook, Mark A.& Payne, Annette. Comparative (Computational) Analysis of the DNA Methylation Status of Trinucleotide Repeat Expansion Diseases. Journal of Nucleic Acids. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-490761
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-490761
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)