![](/images/graphics-bg.png)
HLA-Modeler : Automated Homology Modeling of Human Leukocyte Antigens
المؤلفون المشاركون
Hirayama, Noriaki
Kataoka, Ryoichi
Ikegami, Takashi
Amari, Shinji
المصدر
International Journal of Medicinal Chemistry
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-11-27
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The three-dimensional (3D) structures of human leukocyte antigen (HLA) molecules are indispensable for the studies on the functions at molecular level.
We have developed a homology modeling system named HLA-modeler specialized in the HLA molecules.
Segment matching algorithm is employed for modeling and the optimization of the model is carried out by use of the PFROSST force field considering the implicit solvent model.
In order to efficiently construct the homology models, HLA-modeler uses a local database of the 3D structures of HLA molecules.
The structure of the antigenic peptide-binding site is important for the function and the 3D structure is highly conserved between various alleles.
HLA-modeler optimizes the use of this structural motif.
The leave-one-out cross-validation using the crystal structures of class I and class II HLA molecules has demonstrated that the rmsds of nonhydrogen atoms of the sites between homology models and crystal structures are less than 1.0 Å in most cases.
The results have indicated that the 3D structures of the antigenic peptide-binding sites can be reproduced by HLA-modeler at the level almost corresponding to the crystal structures.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Amari, Shinji& Kataoka, Ryoichi& Ikegami, Takashi& Hirayama, Noriaki. 2013. HLA-Modeler : Automated Homology Modeling of Human Leukocyte Antigens. International Journal of Medicinal Chemistry،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-490827
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Amari, Shinji…[et al.]. HLA-Modeler : Automated Homology Modeling of Human Leukocyte Antigens. International Journal of Medicinal Chemistry No. 2013 (2013), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-490827
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Amari, Shinji& Kataoka, Ryoichi& Ikegami, Takashi& Hirayama, Noriaki. HLA-Modeler : Automated Homology Modeling of Human Leukocyte Antigens. International Journal of Medicinal Chemistry. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-490827
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-490827
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)