![](/images/graphics-bg.png)
A Novel Partial Sequence Alignment Tool for Finding Large Deletions
المؤلفون المشاركون
Kursun, Olcay
Ustek, Duran
Aruk, Taner
المصدر
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-04-01
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Finding large deletions in genome sequences has become increasingly more useful in bioinformatics, such as in clinical research and diagnosis.
Although there are a number of publically available next generation sequencing mapping and sequence alignment programs, these software packages do not correctly align fragments containing deletions larger than one kb.
We present a fast alignment software package, BinaryPartialAlign, that can be used by wet lab scientists to find long structural variations in their experiments.
For BinaryPartialAlign, we make use of the Smith-Waterman (SW) algorithm with a binary-search-based approach for alignment with large gaps that we called partial alignment.
BinaryPartialAlign implementation is compared with other straight-forward applications of SW.
Simulation results on mtDNA fragments demonstrate the effectiveness (runtime and accuracy) of the proposed method.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Aruk, Taner& Ustek, Duran& Kursun, Olcay. 2012. A Novel Partial Sequence Alignment Tool for Finding Large Deletions. The Scientific World Journal،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-491213
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Aruk, Taner…[et al.]. A Novel Partial Sequence Alignment Tool for Finding Large Deletions. The Scientific World Journal No. 2012 (2012), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-491213
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Aruk, Taner& Ustek, Duran& Kursun, Olcay. A Novel Partial Sequence Alignment Tool for Finding Large Deletions. The Scientific World Journal. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-491213
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-491213
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)