Metabolic Modeling of Common Escherichia coli Strains in Human Gut Microbiome
المؤلفون المشاركون
Huang, Jing-Fei
Zhao, Yuqi
Gao, Yue-Dong
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-07-13
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The recent high-throughput sequencing has enabled the composition of Escherichia coli strains in the human microbial community to be profiled en masse.
However, there are two challenges to address: (1) exploring the genetic differences between E.
coli strains in human gut and (2) dynamic responses of E.
coli to diverse stress conditions.
As a result, we investigated the E.
coli strains in human gut microbiome using deep sequencing data and reconstructed genome-wide metabolic networks for the three most common E.
coli strains, including E.
coli HS, UTI89, and CFT073.
The metabolic models show obvious strain-specific characteristics, both in network contents and in behaviors.
We predicted optimal biomass production for three models on four different carbon sources (acetate, ethanol, glucose, and succinate) and found that these stress-associated genes were involved in host-microbial interactions and increased in human obesity.
Besides, it shows that the growth rates are similar among the models, but the flux distributions are different, even in E.
coli core reactions.
The correlations between human diabetes-associated metabolic reactions in the E.
coli models were also predicted.
The study provides a systems perspective on E.
coli strains in human gut microbiome and will be helpful in integrating diverse data sources in the following study.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Gao, Yue-Dong& Zhao, Yuqi& Huang, Jing-Fei. 2014. Metabolic Modeling of Common Escherichia coli Strains in Human Gut Microbiome. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-491231
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Gao, Yue-Dong…[et al.]. Metabolic Modeling of Common Escherichia coli Strains in Human Gut Microbiome. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-491231
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Gao, Yue-Dong& Zhao, Yuqi& Huang, Jing-Fei. Metabolic Modeling of Common Escherichia coli Strains in Human Gut Microbiome. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-491231
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-491231
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر