Partitioning a PPI Network into Overlapping Modules Constrained by High-Density and Periphery Tracking
المؤلفون المشاركون
Altaf-Ul-Amin, Md.
Kanaya, Shigehiko
Wada, Masayoshi
المصدر
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-05-23
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
This paper presents an algorithm called DPClusO for partitioning simple graphs into overlapping modules, that is, clusters constrained by density and periphery tracking.
The major advantages of DPClusO over the related and previously published algorithm DPClus are shorter running time and ensuring coverage, that is, each node goes to at least one module.
DPClusO is a general-purpose clustering algorithm and useful for finding overlapping cohesive groups in a simple graph for any type of application.
This work shows that the modules generated by DPClusO from several PPI networks of yeast with high-density constraint match with more known complexes compared to some other recently published complex generating algorithms.
Furthermore, the biological significance of the high density modules has been demonstrated by comparing their P values in the context of Gene Ontology (GO) terms with those of the randomly generated modules having the same size, distribution, and zero density.
As a consequence, it was also learnt that a PPI network is a combination of mainly high-density and star-like modules.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Altaf-Ul-Amin, Md.& Wada, Masayoshi& Kanaya, Shigehiko. 2012. Partitioning a PPI Network into Overlapping Modules Constrained by High-Density and Periphery Tracking. ISRN Biomathematics،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-493757
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Altaf-Ul-Amin, Md.…[et al.]. Partitioning a PPI Network into Overlapping Modules Constrained by High-Density and Periphery Tracking. ISRN Biomathematics No. 2012 (2012), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-493757
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Altaf-Ul-Amin, Md.& Wada, Masayoshi& Kanaya, Shigehiko. Partitioning a PPI Network into Overlapping Modules Constrained by High-Density and Periphery Tracking. ISRN Biomathematics. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-493757
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-493757
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر