BLAT-Based Comparative Analysis for Transposable Elements : BLATCAT
المؤلفون المشاركون
Han, Kyudong
Oh, Sumin
Kang, Keunsoo
Lee, Sangbum
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-05-18
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The availability of several whole genome sequences makes comparative analyses possible.
In primate genomes, the priority of transposable elements (TEs) is significantly increased because they account for ~45% of the primate genomes, they can regulate the gene expression level, and they are associated with genomic fluidity in their host genomes.
Here, we developed the BLAST-like alignment tool (BLAT) based comparative analysis for transposable elements (BLATCAT) program.
The BLATCAT program can compare specific regions of six representative primate genome sequences (human, chimpanzee, gorilla, orangutan, gibbon, and rhesus macaque) on the basis of BLAT and simultaneously carry out RepeatMasker and/or Censor functions, which are widely used Windows-based web-server functions to detect TEs.
All results can be stored as a HTML file for manual inspection of a specific locus.
BLATCAT will be very convenient and efficient for comparative analyses of TEs in various primate genomes.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Lee, Sangbum& Oh, Sumin& Kang, Keunsoo& Han, Kyudong. 2014. BLAT-Based Comparative Analysis for Transposable Elements : BLATCAT. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-494148
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Lee, Sangbum…[et al.]. BLAT-Based Comparative Analysis for Transposable Elements : BLATCAT. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-494148
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Lee, Sangbum& Oh, Sumin& Kang, Keunsoo& Han, Kyudong. BLAT-Based Comparative Analysis for Transposable Elements : BLATCAT. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-494148
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-494148
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر