![](/images/graphics-bg.png)
Assessing the Quality of Whole Genome Alignments in Bacteria
المؤلفون المشاركون
المصدر
العدد
المجلد 2009، العدد 2009 (31 ديسمبر/كانون الأول 2009)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2009-11-15
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Comparing genomes is an essential preliminary step to solve many problems in biology.
Matching long similar segments between two genomes is a precondition for their evolutionary, genetic, and genome rearrangement analyses.
Though various comparison methods have been developed in recent years, a quantitative assessment of their performance is lacking.
Here, we describe two families of assessment measures whose purpose is to evaluate bacteria-oriented comparison tools.
The first measure is based on how well the genome segmentation fits the gene annotation of the studied organisms; the second uses the number of segments created by the segmentation and the percentage of the two genomes that are conserved.
The effectiveness of the two measures is demonstrated by applying them to the results of genome comparison tools obtained on 41 pairs of bacterial species.
Despite the difference in the nature of the two types of measurements, both show consistent results, providing insights into the subtle differences between the mapping tools.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Swidan, Firas& Shamir, Ron. 2009. Assessing the Quality of Whole Genome Alignments in Bacteria. Advances in Bioinformatics،Vol. 2009, no. 2009, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-495631
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Swidan, Firas& Shamir, Ron. Assessing the Quality of Whole Genome Alignments in Bacteria. Advances in Bioinformatics No. 2009 (2009), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-495631
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Swidan, Firas& Shamir, Ron. Assessing the Quality of Whole Genome Alignments in Bacteria. Advances in Bioinformatics. 2009. Vol. 2009, no. 2009, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-495631
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-495631
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)