Hardware Accelerated Sequence Alignment with Traceback
المؤلفون المشاركون
المصدر
International Journal of Reconfigurable Computing
العدد
المجلد 2009، العدد 2009 (31 ديسمبر/كانون الأول 2009)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2010-01-26
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Biological sequence alignment is an essential tool used in molecular biology and biomedical applications.
The growing volume of genetic data and the complexity of sequence alignment present a challenge in obtaining alignment results in a timely manner.
Known methods to accelerate alignment on reconfigurable hardware only address sequence comparison, limit the sequence length, or exhibit memory and I/O bottlenecks.
A space-efficient, global sequence alignment algorithm and architecture is presented that accelerates the forward scan and traceback in hardware without memory and I/O limitations.
With 256 processing elements in FPGA technology, a performance gain over 300 times that of a desktop computer is demonstrated on sequence lengths of 16000.
For greater performance, the architecture is scalable to more processing elements.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Lloyd, Scott& Snell, Quinn O.. 2010. Hardware Accelerated Sequence Alignment with Traceback. International Journal of Reconfigurable Computing،Vol. 2009, no. 2009, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-496781
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Lloyd, Scott& Snell, Quinn O.. Hardware Accelerated Sequence Alignment with Traceback. International Journal of Reconfigurable Computing No. 2009 (2009), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-496781
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Lloyd, Scott& Snell, Quinn O.. Hardware Accelerated Sequence Alignment with Traceback. International Journal of Reconfigurable Computing. 2010. Vol. 2009, no. 2009, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-496781
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-496781
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر