![](/images/graphics-bg.png)
Accurate and Scalable Techniques for the ComplexPathway Membership Problem in Protein Networks
المؤلفون المشاركون
Singh, Ambuj K.
Çamoğlu, Orhan
Can, Tolga
المصدر
العدد
المجلد 2009، العدد 2009 (31 ديسمبر/كانون الأول 2009)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2010-02-23
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
A protein network shows physical interactions as well as functional associations.
An important usage of such networks is to discover unknown members of partially known complexes and pathways.
A number of methods exist for such analyses, and they can be divided into two main categories based on their treatment of highly connected proteins.
In this paper, we show that methods that are not affected by the degree (number of linkages) of a protein give more accurate predictions for certain complexes and pathways.
We propose a network flow-based technique to compute the association probability of a pair of proteins.
We extend the proposed technique using hierarchical clustering in order to scale well with the size of proteome.
We also show that top-k queries are not suitable for a large number of cases, and threshold queries are more meaningful in these cases.
Network flow technique with clustering is able to optimize meaningful threshold queries and answer them with high efficiency compared to a similar method that uses Monte Carlo simulation.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Çamoğlu, Orhan& Can, Tolga& Singh, Ambuj K.. 2010. Accurate and Scalable Techniques for the ComplexPathway Membership Problem in Protein Networks. Advances in Bioinformatics،Vol. 2009, no. 2009, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-498071
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Çamoğlu, Orhan…[et al.]. Accurate and Scalable Techniques for the ComplexPathway Membership Problem in Protein Networks. Advances in Bioinformatics No. 2009 (2009), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-498071
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Çamoğlu, Orhan& Can, Tolga& Singh, Ambuj K.. Accurate and Scalable Techniques for the ComplexPathway Membership Problem in Protein Networks. Advances in Bioinformatics. 2010. Vol. 2009, no. 2009, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-498071
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-498071
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)