Efficient Serial and Parallel Algorithms for Selection of Unique Oligos in EST Databases
المؤلفون المشاركون
Shalaby, Nabil
Sheppard, Bradley
Mata-Montero, Manrique
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-04-08
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Obtaining unique oligos from an EST database is a problem of great importance in bioinformatics, particularly in the discovery of new genes and the mapping of the human genome.
Many algorithms have been developed to find unique oligos, many of which are much less time consuming than the traditional brute force approach.
An algorithm was presented by Zheng et al.
(2004) which finds the solution of the unique oligos search problem efficiently.
We implement this algorithm as well as several new algorithms based on some theorems included in this paper.
We demonstrate how, with these new algorithms, we can obtain unique oligos much faster than with previous ones.
We parallelize these new algorithms to further improve the time of finding unique oligos.
All algorithms are run on ESTs obtained from a Barley EST database.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Mata-Montero, Manrique& Shalaby, Nabil& Sheppard, Bradley. 2013. Efficient Serial and Parallel Algorithms for Selection of Unique Oligos in EST Databases. Advances in Bioinformatics،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-498549
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Mata-Montero, Manrique…[et al.]. Efficient Serial and Parallel Algorithms for Selection of Unique Oligos in EST Databases. Advances in Bioinformatics No. 2013 (2013), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-498549
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Mata-Montero, Manrique& Shalaby, Nabil& Sheppard, Bradley. Efficient Serial and Parallel Algorithms for Selection of Unique Oligos in EST Databases. Advances in Bioinformatics. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-498549
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-498549
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر