Detection of Introns in Eukaryotic Small Subunit Ribosomal RNA Gene Sequences
المؤلفون المشاركون
Bachar, Dipankar
Guillou, Laure
Christen, Richard
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-02-06
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The gene encoding SSU-rRNA sequences is the tool of choice for phylogenetic analyses and environmental biodiversity analyses of bacteria, Archaea but also unicellular Eukaryota.
In Eukaryota, gene sequences may often be interrupted by long or several introns.
Searching in GenBank release 188, we found descriptions of 3638 such sequences.
Using a database of 180 000 SSU-rRNA sequences well annotated for taxonomy and a C++ program written for that purpose, we computed the presence of 18 691 introns (among which the 3638 described introns).
Filtering on length and sequence quality, 3646 sequences were retained.
These introns were clustered; clusters were analyzed for the presence of single or multiple clades at various levels of taxonomic depth, allowing future analyses of horizontal transfers.
Various analyses of the results are provided as tabulated files as well as FASTA files of described or computed introns.
Each sequence is annotated for cellular location (nuclear, chloroplast, and mitochondria), positions at which they were found in the SSU-rRNA sequences and taxonomy as provided by GenBank.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Bachar, Dipankar& Guillou, Laure& Christen, Richard. 2013. Detection of Introns in Eukaryotic Small Subunit Ribosomal RNA Gene Sequences. Dataset Papers in Biology،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-503668
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Bachar, Dipankar…[et al.]. Detection of Introns in Eukaryotic Small Subunit Ribosomal RNA Gene Sequences. Dataset Papers in Biology No. 2013 (2013), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-503668
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Bachar, Dipankar& Guillou, Laure& Christen, Richard. Detection of Introns in Eukaryotic Small Subunit Ribosomal RNA Gene Sequences. Dataset Papers in Biology. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-503668
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-503668
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر