Population-Sequencing as a Biomarker for Sample Characterization
المؤلف
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-12-08
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Sequencing is accepted as the “gold” standard for genetic analysis and continues to be used as a validation and reference tool.
The idea of using sequence analysis directly for sample characterization has been met with skepticism.
However, herein, utility of direct use of sequencing to identify multiple genomes present in samples is presented and reviewed.
All samples and “pure” isolates are populations of genomes.
Population-Sequencing is the use of probabilistic matching tools in combination with large volumes of sequence information to identify genomes present, based on DNA analysis across entire genomes to determine genome assignments, to calculate confidence scores of major and minor genome content.
Accurate genome identification from mixtures without culture purification steps can achieve phylogenetic classification by direct analysis of millions of DNA fragments.
Genome sequencing data of mixtures can function as biomarkers for use to interrogate genetic content of samples and to establish a sample profile, inclusive of major and minor genome components, drill down to identify rare SNP and mutation events, compare relatedness of genetic content between samples, profile-to-profile, and provide a probabilistic or statistical scoring confidence for sample characterization and attribution.
The application of Population-Sequencing will facilitate sample characterization and genome identification strategies.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Jakupciak, John P.. 2013. Population-Sequencing as a Biomarker for Sample Characterization. Journal of Biomarkers،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-504221
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Jakupciak, John P.. Population-Sequencing as a Biomarker for Sample Characterization. Journal of Biomarkers No. 2013 (2013), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-504221
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Jakupciak, John P.. Population-Sequencing as a Biomarker for Sample Characterization. Journal of Biomarkers. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-504221
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-504221
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر