![](/images/graphics-bg.png)
SNiPloid : A Utility to Exploit High-Throughput SNP Data Derived from RNA-Seq in Allopolyploid Species
المؤلفون المشاركون
Combes, Marie-Christine
Lashermes, Philippe
Cenci, Alberto
Peralta, Marine
Dereeper, Alexis
المصدر
International Journal of Plant Genomics
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-09-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
High-throughput sequencing is a common approach to discover SNP variants, especially in plant species.
However, methods to analyze predicted SNPs are often optimized for diploid plant species whereas many crop species are allopolyploids and combine related but divergent subgenomes (homoeologous chromosome sets).
We created a software tool, SNiPloid, that exploits and interprets putative SNPs in the context of allopolyploidy by comparing SNPs from an allopolyploid with those obtained in its modern-day diploid progenitors.
SNiPloid can compare SNPs obtained from a sample to estimate the subgenome contribution to the transcriptome or SNPs obtained from two polyploid accessions to search for SNP divergence.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Peralta, Marine& Combes, Marie-Christine& Cenci, Alberto& Lashermes, Philippe& Dereeper, Alexis. 2013. SNiPloid : A Utility to Exploit High-Throughput SNP Data Derived from RNA-Seq in Allopolyploid Species. International Journal of Plant Genomics،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-505686
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Peralta, Marine…[et al.]. SNiPloid : A Utility to Exploit High-Throughput SNP Data Derived from RNA-Seq in Allopolyploid Species. International Journal of Plant Genomics No. 2013 (2013), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-505686
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Peralta, Marine& Combes, Marie-Christine& Cenci, Alberto& Lashermes, Philippe& Dereeper, Alexis. SNiPloid : A Utility to Exploit High-Throughput SNP Data Derived from RNA-Seq in Allopolyploid Species. International Journal of Plant Genomics. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-505686
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-505686
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)