Bayesian Mixture Model Analysis for Detecting Differentially Expressed Genes
المؤلفون المشاركون
المصدر
International Journal of Plant Genomics
العدد
المجلد 2008، العدد 2008 (31 ديسمبر/كانون الأول 2008)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2008-03-25
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Control-treatment design is widely used in microarray gene expression experiments.
The purpose of such a design is to detect genes that express differentially between the control and the treatment.
Many statistical procedures have been developed to detect differentially expressed genes, but all have pros and cons and room is still open for improvement.
In this study, we propose a Bayesian mixture model approach to classifying genes into one of three clusters, corresponding to clusters of downregulated, neutral, and upregulated genes, respectively.
The Bayesian method is implemented via the Markov chain Monte Carlo (MCMC) algorithm.
The cluster means of down- and upregulated genes are sampled from truncated normal distributions whereas the cluster mean of the neutral genes is set to zero.
Using simulated data as well as data from a real microarray experiment, we demonstrate that the new method outperforms all methods commonly used in differential expression analysis.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Jia, Zhenyu& Xu, Shizhong. 2008. Bayesian Mixture Model Analysis for Detecting Differentially Expressed Genes. International Journal of Plant Genomics،Vol. 2008, no. 2008, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-505970
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Jia, Zhenyu& Xu, Shizhong. Bayesian Mixture Model Analysis for Detecting Differentially Expressed Genes. International Journal of Plant Genomics No. 2008 (2008), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-505970
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Jia, Zhenyu& Xu, Shizhong. Bayesian Mixture Model Analysis for Detecting Differentially Expressed Genes. International Journal of Plant Genomics. 2008. Vol. 2008, no. 2008, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-505970
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-505970
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر