Towards a Computational Model of a Methane Producing Archaeum
المؤلفون المشاركون
Ellermeier, Jeremy R.
Luthey-Schulten, Zaida
Peterson, Joseph R.
Kohler, Petra R. A.
Jain, Ankur
Labhsetwar, Piyush
Ha, Taekjip
Metcalf, William W.
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-18، 18ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-03-04
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
18
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Progress towards a complete model of the methanogenic archaeum Methanosarcina acetivorans is reported.
We characterized size distribution of the cells using differential interference contrast microscopy, finding them to be ellipsoidal with mean length and width of 2.9 μm and 2.3 μm, respectively, when grown on methanol and 30% smaller when grown on acetate.
We used the single molecule pull down (SiMPull) technique to measure average copy number of the Mcr complex and ribosomes.
A kinetic model for the methanogenesis pathways based on biochemical studies and recent metabolic reconstructions for several related methanogens is presented.
In this model, 26 reactions in the methanogenesis pathways are coupled to a cell mass production reaction that updates enzyme concentrations.
RNA expression data (RNA-seq) measured for cell cultures grown on acetate and methanol is used to estimate relative protein production per mole of ATP consumed.
The model captures the experimentally observed methane production rates for cells growing on methanol and is most sensitive to the number of methyl-coenzyme-M reductase (Mcr) and methyl-tetrahydromethanopterin:coenzyme-M methyltransferase (Mtr) proteins.
A draft transcriptional regulation network based on known interactions is proposed which we intend to integrate with the kinetic model to allow dynamic regulation.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Peterson, Joseph R.& Labhsetwar, Piyush& Ellermeier, Jeremy R.& Kohler, Petra R. A.& Jain, Ankur& Ha, Taekjip…[et al.]. 2014. Towards a Computational Model of a Methane Producing Archaeum. Archaea،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-18.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-506472
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Peterson, Joseph R.…[et al.]. Towards a Computational Model of a Methane Producing Archaeum. Archaea No. 2014 (2014), pp.1-18.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-506472
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Peterson, Joseph R.& Labhsetwar, Piyush& Ellermeier, Jeremy R.& Kohler, Petra R. A.& Jain, Ankur& Ha, Taekjip…[et al.]. Towards a Computational Model of a Methane Producing Archaeum. Archaea. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-18.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-506472
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-506472
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر