Statistical Analysis of Terminal Extensions of Protein β-Strand Pairs
المؤلفون المشاركون
Gao, Shan
Ruan, Jishou
Zhang, Tao
Zhang, Lei
Zhang, Ning
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-01-28
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
The long-range interactions, required to the accurate predictions of tertiary structures of β-sheet-containing proteins, are still difficult to simulate.
To remedy this problem and to facilitate β-sheet structure predictions, many efforts have been made by computational methods.
However, known efforts on β-sheets mainly focus on interresidue contacts or amino acid partners.
In this study, to go one step further, we studied β-sheets on the strand level, in which a statistical analysis was made on the terminal extensions of paired β-strands.
In most cases, the two paired β-strands have different lengths, and terminal extensions exist.
The terminal extensions are the extended part of the paired strands besides the common paired part.
However, we found that the best pairing required a terminal alignment, and β-strands tend to pair to make bigger common parts.
As a result, 96.97% of β-strand pairs have a ratio of 25% of the paired common part to the whole length.
Also 94.26% and 95.98% of β-strand pairs have a ratio of 40% of the paired common part to the length of the two β-strands, respectively.
Interstrand register predictions by searching interacting β-strands from several alternative offsets should comply with this rule to reduce the computational searching space to improve the performances of algorithms.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Zhang, Ning& Gao, Shan& Zhang, Lei& Ruan, Jishou& Zhang, Tao. 2013. Statistical Analysis of Terminal Extensions of Protein β-Strand Pairs. Advances in Bioinformatics،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-507316
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Zhang, Ning…[et al.]. Statistical Analysis of Terminal Extensions of Protein β-Strand Pairs. Advances in Bioinformatics No. 2013 (2013), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-507316
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Zhang, Ning& Gao, Shan& Zhang, Lei& Ruan, Jishou& Zhang, Tao. Statistical Analysis of Terminal Extensions of Protein β-Strand Pairs. Advances in Bioinformatics. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-507316
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-507316
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر