A Multilevel Gamma-Clustering Layout Algorithm for Visualization of Biological Networks
المؤلفون المشاركون
Hruz, Tomas
Wyss, Markus
von Rohr, Peter
Zimmermann, Philip
Bleuler, Stefan
Lucas, Christoph
Laule, Oliver
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-06-26
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Visualization of large complex networks has become an indispensable part of systems biology, where organisms need to be considered as one complex system.
The visualization of the corresponding network is challenging due to the size and density of edges.
In many cases, the use of standard visualization algorithms can lead to high running times and poorly readable visualizations due to many edge crossings.
We suggest an approach that analyzes the structure of the graph first and then generates a new graph which contains specific semantic symbols for regular substructures like dense clusters.
We propose a multilevel gamma-clustering layout visualization algorithm (MLGA) which proceeds in three subsequent steps: (i) a multilevel γ-clustering is used to identify the structure of the underlying network, (ii) the network is transformed to a tree, and (iii) finally, the resulting tree which shows the network structure is drawn using a variation of a force-directed algorithm.
The algorithm has a potential to visualize very large networks because it uses modern clustering heuristics which are optimized for large graphs.
Moreover, most of the edges are removed from the visual representation which allows keeping the overview over complex graphs with dense subgraphs.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hruz, Tomas& Wyss, Markus& Lucas, Christoph& Laule, Oliver& von Rohr, Peter& Zimmermann, Philip…[et al.]. 2013. A Multilevel Gamma-Clustering Layout Algorithm for Visualization of Biological Networks. Advances in Bioinformatics،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-508201
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hruz, Tomas…[et al.]. A Multilevel Gamma-Clustering Layout Algorithm for Visualization of Biological Networks. Advances in Bioinformatics No. 2013 (2013), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-508201
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hruz, Tomas& Wyss, Markus& Lucas, Christoph& Laule, Oliver& von Rohr, Peter& Zimmermann, Philip…[et al.]. A Multilevel Gamma-Clustering Layout Algorithm for Visualization of Biological Networks. Advances in Bioinformatics. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-508201
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-508201
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر