![](/images/graphics-bg.png)
Parallel Solutions for Voxel-Based Simulations of Reaction-Diffusion Systems
المؤلفون المشاركون
D’Agostino, Daniele
Mosca, Ettore
Clematis, Andrea
Milanesi, Luciano
Maj, Carlo
Pasquale, Giulia
Merelli, Ivan
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-06-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
There is an increasing awareness of the pivotal role of noise in biochemical processes and of the effect of molecular crowding on the dynamics of biochemical systems.
This necessity has given rise to a strong need for suitable and sophisticated algorithms for the simulation of biological phenomena taking into account both spatial effects and noise.
However, the high computational effort characterizing simulation approaches, coupled with the necessity to simulate the models several times to achieve statistically relevant information on the model behaviours, makes such kind of algorithms very time-consuming for studying real systems.
So far, different parallelization approaches have been deployed to reduce the computational time required to simulate the temporal dynamics of biochemical systems using stochastic algorithms.
In this work we discuss these aspects for the spatial TAU-leaping in crowded compartments (STAUCC) simulator, a voxel-based method for the stochastic simulation of reaction-diffusion processes which relies on the Sτ-DPP algorithm.
In particular we present how the characteristics of the algorithm can be exploited for an effective parallelization on the present heterogeneous HPC architectures.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
D’Agostino, Daniele& Pasquale, Giulia& Clematis, Andrea& Maj, Carlo& Mosca, Ettore& Milanesi, Luciano…[et al.]. 2014. Parallel Solutions for Voxel-Based Simulations of Reaction-Diffusion Systems. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-513199
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
D’Agostino, Daniele…[et al.]. Parallel Solutions for Voxel-Based Simulations of Reaction-Diffusion Systems. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-513199
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
D’Agostino, Daniele& Pasquale, Giulia& Clematis, Andrea& Maj, Carlo& Mosca, Ettore& Milanesi, Luciano…[et al.]. Parallel Solutions for Voxel-Based Simulations of Reaction-Diffusion Systems. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-513199
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-513199
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)