Evidence for Directed Evolution of Larger Size Motif in Arabidopsis thaliana Genome
المؤلفون المشاركون
Karan, Ratna
Mehrotra, Sandhya
Mehrotra, Rajesh
Bhalothia, Purva
Yadav, Amit
المصدر
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-5، 5ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-05-03
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
5
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Transcription control of gene expression depends on a variety of interactions mediated by the core promoter region, sequence specific DNA-binding proteins, and their cognate promoter elements.
The prominent group of cis acting elements in plants contains an ACGT core.
The cis element with this core has been shown to be involved in abscisic acid, salicylic acid, and light response.
In this study, genome-wide comparison of the frequency of occurrence of two ACGT elements without any spacers as well as those separated by spacers of different length was carried out.
In the first step, the frequency of occurrence of the cis element sequences across the whole genome was determined by using BLAST tool.
In another approach the spacer sequence was randomized before making the query.
As expected, the sequence ACGTACGT had maximum occurrence in Arabidopsis thaliana genome.
As we increased the spacer length, one nucleotide at a time, the probability of its occurrence in genome decreased.
This trend continued until an unexpectedly sharp rise in frequency of (ACGT)N25(ACGT).
The observation of higher probability of bigger size motif suggests its directed evolution in Arabidopsis thaliana genome.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Mehrotra, Rajesh& Yadav, Amit& Bhalothia, Purva& Karan, Ratna& Mehrotra, Sandhya. 2012. Evidence for Directed Evolution of Larger Size Motif in Arabidopsis thaliana Genome. The Scientific World Journal،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-5.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-513496
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Mehrotra, Rajesh…[et al.]. Evidence for Directed Evolution of Larger Size Motif in Arabidopsis thaliana Genome. The Scientific World Journal No. 2012 (2012), pp.1-5.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-513496
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Mehrotra, Rajesh& Yadav, Amit& Bhalothia, Purva& Karan, Ratna& Mehrotra, Sandhya. Evidence for Directed Evolution of Larger Size Motif in Arabidopsis thaliana Genome. The Scientific World Journal. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-5.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-513496
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-513496
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر