![](/images/graphics-bg.png)
Advanced Heat Map and Clustering Analysis Using Heatmap3
المؤلفون المشاركون
Shyr, Yu
Sheng, Quanhu
Guo, Yan
Zhao, Shilin
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-07-16
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Heat maps and clustering are used frequently in expression analysis studies for data visualization and quality control.
Simple clustering and heat maps can be produced from the “heatmap” function in R.
However, the “heatmap” function lacks certain functionalities and customizability, preventing it from generating advanced heat maps and dendrograms.
To tackle the limitations of the “heatmap” function, we have developed an R package “heatmap3” which significantly improves the original “heatmap” function by adding several more powerful and convenient features.
The “heatmap3” package allows users to produce highly customizable state of the art heat maps and dendrograms.
The “heatmap3” package is developed based on the “heatmap” function in R, and it is completely compatible with it.
The new features of “heatmap3” include highly customizable legends and side annotation, a wider range of color selections, new labeling features which allow users to define multiple layers of phenotype variables, and automatically conducted association tests based on the phenotypes provided.
Additional features such as different agglomeration methods for estimating distance between two samples are also added for clustering.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Zhao, Shilin& Guo, Yan& Sheng, Quanhu& Shyr, Yu. 2014. Advanced Heat Map and Clustering Analysis Using Heatmap3. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-513769
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Zhao, Shilin…[et al.]. Advanced Heat Map and Clustering Analysis Using Heatmap3. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-513769
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Zhao, Shilin& Guo, Yan& Sheng, Quanhu& Shyr, Yu. Advanced Heat Map and Clustering Analysis Using Heatmap3. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-513769
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-513769
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)