التنميط الوراثي لبعض العزلات الفطرية اعتمادا على التغاير في منطقة ITS ( internal transcribed spacer)‎ كشفرة وراثية عالمية في تشخيص الفطريات

الملخص AR

هدفت الدراسة إلى تطبيق تقنية التشخيص الجزيئي اعتماد على التغاير في منطقة ITS region لتأكيد تشخيص بعض العزلات الفطرية، فقد استخدمت الشفرة الجينية المعتمدة عالميا كمستوى تشخيصي جزيئي متقدم قياسا بالطرائق التشخيصية التقليدية المظهرية و المجهرية.

و شملت الدراسة خمس عزلات فطرية حيث شخصت العزلات المنتخبة التابعة لأجناسUlo.

alternaria.(1) ، T.harzianum.(1)، p.oxalicum.(1) ،A.flavus.(1) ،A.niger.(2) التي تعود لصف الفطريات الناقصة، و قد تم استخلاص ال DNA و تضخيم منطقة الهدف (ITS1 5.8S ITS2) في rDNA و باستخدام الزوج البادئITS4–ITS1 الذي ضخم و بنجاح منطقة الهدف و لجميع العزلات المختبرة، و انعكس ذلك بظهور خمس حزم على الهلام بأوزان جزيئية مختلفة.

أكدت نتائج تضخيم تفاعل البلمرة المتسلسل وجود تباين في الحزم و لجميع العزلات الفطرية المختلفة و التي تراوحت بين 625-496 زوجا قاعديا.

فقد سجلت عزلات الجنسT.harzianum.(1) أكبر وزن جزيئي 625 زوجا قاعديا، و سجلت عزلة الجنس A.

niger.(2) وزن جزيئي 599 زوجا قاعديا في حين سجل A.flavus.(1) وزن جزيئي 595 زوجا قاعديا.

و قد سجلت عزلة الفطر p.oxalicum.(1) وزن جزيئي575 زوجا قاعديا، في حين سجل الجنس Ulo.

alternaria.(1) اقل وزن جزيئي تراوح بين 496-498 زوجا قاعديا.

و خلصت دراسة التنميط الوراثي إلى أن تقنيات التنميط نجحت في تشخيص العزلات بشكل مميز عند منطقة ال ITS حيث أظهرت خمس حزم مختلفة نتيجة لاختلاف الأنواع و الأجناس للعزلات المختبرة، و قد توافقت و أكدت نتائج هذه الدراسة التشخيص المجهري و المظهري لهذه العزلات.

و توصي الدراسة باعتماد هذه التقنية في الدراسات التصنيفية الجزيئية بعدها طريقة تشخيصية متقدمة و كذلك دقيقة و سريعة.