THz frequency spectrum of BLIP protein-water interaction energy
العناوين الأخرى
الطيف الترددي في مدى التيراهيرتز للطاقة التفاعلية بين بروتين BLIP و الماء المحيط به
مقدم أطروحة جامعية
مشرف أطروحة جامعية
الجامعة
جامعة بيرزيت
الكلية
كلية العلوم
القسم الأكاديمي
دائرة الفيزياء
دولة الجامعة
فلسطين (الضفة الغربية)
الدرجة العلمية
ماجستير
تاريخ الدرجة العلمية
2018
الملخص الإنجليزي
The vibration spectrum of water hydrogen bonds and the large amplitude motion modes of proteins can be characterized by the THz frequency spectrum of protein-water non-bonded interaction energy.
This spectrum can be computed using recurrence plots based on Wiener-Khinchin method (RPWK).
In this thesis, THz frequency spectra for non-bonded interaction energy between all residues in the β-Lactamase Inhibitory Protein (BLIP), and water molecules within 10 angstroms are calculated at 150K and 310K temperatures, respectively.
The results obtained are also compared to those determined using the auto-covariance based Wiener-Khinchin method (WK).
Moreover all residues are grouped together according to their sidechain physico-chemical properties to compare their spectra.
We found that RPWK method robustly detects frequency data points for residues especially at high frequencies.
We also found that most of detected are hydrophilic which consistent with their likely high contact with the solvent.
التخصصات الرئيسية
الموضوعات
عدد الصفحات
43
قائمة المحتويات
Table of contents.
Abstract.
Abstract in Arabic.
[Chapter One] : Introduction.
[Chapter Two] : Methods.
[Chapter Three] : Results and discussion.
[Chapter Four] : Conclusion.
References
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Abu Lubdah, Khadijah Musa. (2018). THz frequency spectrum of BLIP protein-water interaction energy. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Birzeit University, Palestine (West Bank)
https://search.emarefa.net/detail/BIM-837060
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Abu Lubdah, Khadijah Musa. THz frequency spectrum of BLIP protein-water interaction energy. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Birzeit University. (2018).
https://search.emarefa.net/detail/BIM-837060
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Abu Lubdah, Khadijah Musa. (2018). THz frequency spectrum of BLIP protein-water interaction energy. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Birzeit University, Palestine (West Bank)
https://search.emarefa.net/detail/BIM-837060
لغة النص
الإنجليزية
نوع البيانات
رسائل جامعية
رقم السجل
BIM-837060
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر