Bioinformatics analysis of ubiquitin expression protein gene from Heterodera latipons
المؤلفون المشاركون
Lafi, Hamzah A.
Dawabah, Ahmad A. M.
al-Nadari, Salih N.
Sadder, Mundhir T.
al-Banna, Lama
المصدر
Saudi Journal of Biological Sciences
العدد
المجلد 26، العدد 7 (30 نوفمبر/تشرين الثاني 2019)، ص ص. 1463-1467، 5ص.
الناشر
تاريخ النشر
2019-11-30
دولة النشر
السعودية
عدد الصفحات
5
التخصصات الرئيسية
الموضوعات
الملخص EN
Ubiquitin expression protein DNA clone (Hl-UBI) was isolated from Heterodera latipons collected from North Jordan.
Its sequence of 285 nucleotides was also determined and deposited in the GeneBank.
The 285-bp open reading frame coded for 76-amino acid protein having two domains; the ubiquitin domain and the C terminal extension.
The first 59 amino acids were predicted with the ubiquitin domain with identity percentages of 78% to ubiquitin of H.
schachtii, 77% to polyubiquitin of Globodera pallida, 74% to ubiquitin of Globodera rostochiensis and 72% to ubiquitin of Heterodera glycines.
The other domain at the C-terminus, containing 17 amino acids, showed no homology to any known protein.
Sequence analysis showed a calculated encoding amino acids molecular weight of 8.77 kDa, theoretical isoelectric point = 4.76, negatively charged residues = 12, positively charged residues = 9, extinction coefficient = 1490, estimated half-life = 30 h, instability index = 32.51 and grand average of hydropathicity = −0.537.
The demonstrated subcellular localization analysis of cytoplasm, cell nucleus, mitochondrion, cell skeleton and plasma membrane of Hl-UBI protein occupied about 52.20, 21.70, 17.40, 4.30 and 4.30%, respectively.
Sequence, homology and structural analysis confirmed that Hl-UBI gene was highly conserved during evolution and belonged to ubiquitin gene family.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
al-Banna, Lama& Sadder, Mundhir T.& Lafi, Hamzah A.& Dawabah, Ahmad A. M.& al-Nadari, Salih N.. 2019. Bioinformatics analysis of ubiquitin expression protein gene from Heterodera latipons. Saudi Journal of Biological Sciences،Vol. 26, no. 7, pp.1463-1467.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-910156
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
al-Banna, Lama…[et al.]. Bioinformatics analysis of ubiquitin expression protein gene from Heterodera latipons. Saudi Journal of Biological Sciences Vol. 26, no. 7 (Nov. 2019), pp.1463-1467.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-910156
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
al-Banna, Lama& Sadder, Mundhir T.& Lafi, Hamzah A.& Dawabah, Ahmad A. M.& al-Nadari, Salih N.. Bioinformatics analysis of ubiquitin expression protein gene from Heterodera latipons. Saudi Journal of Biological Sciences. 2019. Vol. 26, no. 7, pp.1463-1467.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-910156
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references : p. 1466-1467
رقم السجل
BIM-910156
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر