Heuristic modularity for complex identification in protein-protein interaction networks
العناوين الأخرى
دالة النمطية الموجهة لتحديد المركبات في شبكات التفاعل بين البروتين و البروتين
المؤلفون المشاركون
Abd al-Latif, Aminah Haytham
Atiyyah, Bara Ali
Rashid, Ahmad Nafi
المصدر
العدد
المجلد 60، العدد 8 (31 أغسطس/آب 2019)، ص ص. 1846-1859، 14ص.
الناشر
تاريخ النشر
2019-08-31
دولة النشر
العراق
عدد الصفحات
14
التخصصات الرئيسية
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الموضوعات
الملخص EN
Due to the significant role in understanding cellular processes, the decomposition of Protein-Protein Interaction (PPI) networks into essential building blocks, or complexes, has received much attention for functional bioinformatics research in recent years.
One of the well-known bi-clustering descriptors for identifying communities and complexes in complex networks, such as PPI networks, is modularity function.
The contribution of this paper is to introduce heuristic optimization models that can collaborate with the modularity function to improve its detection ability.
The definitions of the formulated heuristics are based on nodes and different levels of their neighbor properties.
The modularity function and the formulated heuristics are then injected into the mechanism of a single objective Evolutionary Algorithm (EA) tailored specifically to tackle the problem, and thus, to identify possible complexes from PPI networks.
In the experiments, different overlapping scores are used to evaluate the detection accuracy in both complex and protein levels.
According to the evaluation metrics, the results reveal that the introduced heuristics have the ability to harness the accuracy of the existing modularity while identifying protein complexes in the tested PPI networks.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Abd al-Latif, Aminah Haytham& Atiyyah, Bara Ali& Rashid, Ahmad Nafi. 2019. Heuristic modularity for complex identification in protein-protein interaction networks. Iraqi Journal of Science،Vol. 60, no. 8, pp.1846-1859.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-969465
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Abd al-Latif, Aminah Haytham…[et al.]. Heuristic modularity for complex identification in protein-protein interaction networks. Iraqi Journal of Science Vol. 60, no. 8 (2019), pp.1846-1859.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-969465
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Abd al-Latif, Aminah Haytham& Atiyyah, Bara Ali& Rashid, Ahmad Nafi. Heuristic modularity for complex identification in protein-protein interaction networks. Iraqi Journal of Science. 2019. Vol. 60, no. 8, pp.1846-1859.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-969465
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references : p. 1859
رقم السجل
BIM-969465
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر