Global Egr1-miRNAs Binding Analysis in PMA-Induced K562 Cells Using ChIP-Seq
المؤلفون المشاركون
Tang, Chao
Shi, Xiaolong
Wang, Wei
Lu, Zuhong
Zhou, Dequang
Tu, Jing
Xie, Xueying
Ge, Qinyu
المصدر
العدد
المجلد 2010، العدد 2010 (31 ديسمبر/كانون الأول 2009)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2010-07-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Although much is known about microRNAs' regulation in gene expression and their contributions in cell fate, to date, globally lineage-(cell-) specific identification of the binding events between a transcription factor and its targeting microRNA genes is still waiting for elucidation.
In this paper, we performed a ChIP-Seq experiment to find the targeting microRNA genes of a transcription factor, Egr1, in human erythroleukemia cell line K562.
We found Egr1 binding sites near the promoters of 124 distinct microRNA genes, accounting for about 42% of the miRNAs which have high-confidence predicted promoters (294).
We also found EGR1 bind to another 63 pre-miRNAs.
We chose 12 of the 187 microRNAs with Egr1 binding sites to perform ChIP-PCR assays and the positive binding signal from ChIP-PCR confirmed the ChIP-Seq results.
Our experiments provide the first global binding profile between Egr1 and its targeting microRNA genes in PMA-treated K562 cells, which may facilitate the understanding of pathways controlling microRNA biology in this specific cell line.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Wei& Zhou, Dequang& Shi, Xiaolong& Tang, Chao& Xie, Xueying& Tu, Jing…[et al.]. 2010. Global Egr1-miRNAs Binding Analysis in PMA-Induced K562 Cells Using ChIP-Seq. BioMed Research International،Vol. 2010, no. 2010, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-989168
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Wei…[et al.]. Global Egr1-miRNAs Binding Analysis in PMA-Induced K562 Cells Using ChIP-Seq. BioMed Research International No. 2010 (Dec. 2010), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-989168
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Wei& Zhou, Dequang& Shi, Xiaolong& Tang, Chao& Xie, Xueying& Tu, Jing…[et al.]. Global Egr1-miRNAs Binding Analysis in PMA-Induced K562 Cells Using ChIP-Seq. BioMed Research International. 2010. Vol. 2010, no. 2010, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-989168
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-989168
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر